科室介紹
生物樣本庫
又稱生物銀行(Biobank),主要是指標(biāo)準(zhǔn)化收集、處理、儲存和應(yīng)用健康和疾病生物體的生物大分子、細(xì)胞、組織和器官等樣本(包括人體器官組織、全血、血漿、血清、生物體液或經(jīng)處理過的生物樣本(DNA、RNA、蛋白等)以及與這些生物樣本相關(guān)的臨床、病理、治療、隨訪、知情同意等資料及其質(zhì)量控制、信息管理與應(yīng)用系統(tǒng)。 根據(jù)經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織(OECD)的定義,“生物樣本庫(Biobank)是一 種集中保存各種人類生物材料(Human biological material),用于疾病的臨床治療和生命科學(xué)研究的生物應(yīng)用系統(tǒng)”。
生物樣本庫類型
生物樣本庫(Biobank)有多種類型,常見的組織、器官庫(Tissue bank),如血液庫、眼角膜庫、骨髓庫,到擁有正常細(xì)胞、遺傳突變細(xì)胞、腫瘤細(xì)胞和雜交瘤細(xì)胞株(系)的細(xì)胞株(系)庫,近年來出現(xiàn)了臍血干細(xì)胞庫、胚胎干細(xì)胞庫等各種干細(xì)胞庫以及各種人種和疾病的基因組庫(Genome bank)。 這些生物樣本庫(Biobank)為血液病、免疫系統(tǒng)疾病、糖尿病、惡性腫瘤等重大疾病的研究起到了非常重要的推動作用。
生物樣本庫主要形式 1、醫(yī)院或研究機構(gòu)下單個研究人員或者單個科室因其研究需要將其搜集的生物樣本單保存而建立的生物樣本庫(Biobank); 2、醫(yī)院或研究機構(gòu)建立的生物樣本庫(Biobank),進(jìn)行醫(yī)院或研究機構(gòu)內(nèi)部搜集的生物樣本資源統(tǒng)一保存和分配使用; 3、多個醫(yī)院或研究機構(gòu)聯(lián)合組成的生物樣本庫(Biobank),實現(xiàn)各單位搜集的生物樣本集中保存和共享使用; 4、第三方機構(gòu)從社群中搜集大型的隊列生物樣本庫(Biobank),集中保存并在申請審批后不同各研究人員提供樣本。 因為不同類型生物樣本庫的存在,以及搜集樣本的類型和保存方式的不同,其所承擔(dān)的功能和架構(gòu)、工作流程、基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)和設(shè)備配備等情況也會不同。 生物樣本庫信息系統(tǒng) 生物樣本庫(Biobank)資源管理信息系統(tǒng)是為了便利于有效的管理生物樣本和相關(guān)信息所建立的具有搜集、保存、檢索和分析功能的信息系統(tǒng)。其易用性、安全性、可靠性是其重要考核內(nèi)容。為此: 生物樣本庫(Biobank)資源管理信息系統(tǒng)的功能包括但不限于:追蹤捐贈者的問卷和知情同意,管理生物樣本采集、處理、儲存和運輸,管理QA/QC程序和文件,捐贈者臨床數(shù)據(jù)電子采集,數(shù)據(jù)安全保護(hù),報告管理(庫存、采集、使用、QA等報告),臨床和實驗數(shù)據(jù)挖掘。 生物樣本庫(Biobank)資源管理信息系統(tǒng)應(yīng)具有靈活的可擴(kuò)展性,能適應(yīng)和滿足生物樣本庫不斷發(fā)展和變化的需求。應(yīng)定期評估信息系統(tǒng)確保其滿足生物樣本庫工作需要和規(guī)范的要求。 生物樣本庫(Biobank)資源管理信息系統(tǒng)應(yīng)能記錄樣本質(zhì)量,如樣本的儲存溫度環(huán)境和凍融次數(shù)等。 生物樣本庫(Biobank)資源管理信息系統(tǒng)應(yīng)能通過標(biāo)識(如條形碼)將實物樣本關(guān)聯(lián)到信息系統(tǒng)中的相關(guān)數(shù)據(jù)。 識別和追蹤樣本 a) 提取、分裝后的樣本應(yīng)能通過信息系統(tǒng)追溯到原始樣本并與其信息相關(guān)聯(lián); b) 每份樣本在信息系統(tǒng)中應(yīng)有且僅有一個或者一組識別符號(數(shù)字或條形碼); c)樣本從采集到處理、儲存、配送運輸、使用后剩余返回重新儲存等的全過程都應(yīng)被有效記錄; d) 生物樣本的轉(zhuǎn)移應(yīng)被及時記錄,信息系統(tǒng)能追溯到每一個樣本儲存位置的變更。 整體科研規(guī)劃 即從短期、中期和長期三個階段來規(guī)劃本單位的科研目標(biāo),明確各個階段可以采用的科研工具、相關(guān)的資源需求、人員配置等要素; 保存箱空間利用率 樣本積累到一定數(shù)量后,手工方式查找和存放樣本非常困難而且容易出錯,存放樣本的容器(例如冰箱、液氮罐)利用效率也會逐漸降低。因為一開始樣本可能是分類順序存放的,但是根據(jù)科研需求的不同,取樣會從容器的不同位置取走樣本,一段時間后,容器中會產(chǎn)生大量的零散空位卻無法有效利用。這就需要利用信息化系統(tǒng)來進(jìn)行樣本存放位置的自動分配和查找,提高冰箱等容器的空間利用效率。 取樣的準(zhǔn)確性 這直接關(guān)系到實驗結(jié)果和研究結(jié)論,有時卻被忽視了。我們曾經(jīng)聽說過這樣的事例:一個研究某種女性疾病的課題,提供了一批患者樣本給商業(yè)服務(wù)機構(gòu)進(jìn)行基因分析,實驗過程中卻發(fā)現(xiàn)其中一些樣本對應(yīng)的患者是男性,這就使得這一批樣本基本失去了價值。要避免這樣的問題出現(xiàn),可以通過已經(jīng)很成熟的低溫條形碼標(biāo)簽技術(shù),掃描條形碼在軟件工具中進(jìn)行相關(guān)信息的核對,就能有效的確保取樣的準(zhǔn)確性。 配套臨床資料的管理 收集和保存樣本的目的是為了根據(jù)臨床科研的需要,對病人的樣本進(jìn)行篩選,通過分子生物學(xué)實驗得到患者外在癥狀和內(nèi)在的基因、蛋白等表達(dá)之間的關(guān)聯(lián),如果一 份樣本缺乏完整配套的臨床資料,則篩選的依據(jù)不足,樣本的科研價值就大打折扣了。 生物樣本的質(zhì)量控制 包括樣本采集分裝、入庫、取樣、出庫整個過程中對樣本質(zhì)量的監(jiān)控,避免樣本出現(xiàn)污染、降解等質(zhì)量問題;